Профессор Козлов является действительным членом Европейского общества по клинической микробиологии и инфекционным болезням (ESCMID), Американского общества микробиологов (ASM), Европейского респираторного общества (ERS) и Федерации европейских обществ по антимикробной химиотерапии (FESCI). Проф. Козлов получил научную степень кандидата, а затем доктора медицинских наук по клинической фармакологии и микробиологии в Смоленской государственной медицинской академии. В 1996 году он стал обладателем степени Магистра наук по клинической микробиологии Лондонского Университета, в 2005 г. - первой премии ESCMID за выдающиеся достижения в области клинической микробиологии и инфекционных болезней, в 2012 г. – премии Международного союза за разумное применение антибиотиков (APUA) за выдающиеся лидерские качества в области разумного применения антибиотиков с целью сохранения эффективных препаратов для будущих поколений, а также в 1995 и 2009 гг. - грантов Президента Российской Федерации С марта 2015 г. является главным внештатным специалистом Министерства здравоохранения Российской Федерации по клинической микробиологии и антимикробной резистентности. Профессор Козлов является автором и соавтором более 500 научных трудов.